Ghost in the Shell S.A.C. 2nd GIG 2002 เรื่องราวสุดล้ำของการแฮ็กที่เต็มไปด้วยการเมืองและการต่อสู้ทางข้อมูลได้เริ่มต้นขึ้น ภาพหลักของซีรีส์นี้คือแฮ็กเกอร์ที่รู้จักกันในชื่อ Laughing Man ซึ่งท้าทายการควบคุมจากรัฐบาลและบริษัทข้ามชาติที่พยายามปกปิดความจริงที่เกี่ยวข้องกับการรักษาโรคไซเบอร์ที่มีต้นทุนต่ำเพื่อแสวงหากำไรจากเทคโนโลยีราคาแพงที่พวกเขาคิดค้นขึ้นมา เรื่องราวเริ่มต้นจากการที่แฮ็กเกอร์ Laughing Man ค้นพบข้อมูลที่รัฐบาลญี่ปุ่นและบริษัทผลิตไมโครแมชชีนพยายามปกปิดไว้ ด้วยการใช้เครื่องมือการแฮ็ก เขาได้เผยแพร่ความจริงให้คนทั่วโลกได้เห็น โดยการบังคับให้เจ้าของบริษัทหนึ่งเปิดเผยข้อมูลในรายการโทรทัศน์สด ซึ่งในระหว่างการถ่ายทอดสด เขาได้แฮ็กกล้องของผู้ชมทั้งหมด และแสดงโลโก้หน้าหัวเราะที่มีความเก๋ไก๋ ซึ่งกลายเป็นสัญลักษณ์ของเขาในโลกไซเบอร์ การกระทำของ Laughing Man กลายเป็นที่รู้จักและได้รับการเลียนแบบอย่างแพร่หลาย โดยเกิดการเคลื่อนไหวในรูปแบบ Stand Alone Complex ซึ่งเป็นชุดของเหตุการณ์ที่ไม่เกี่ยวข้องกันแต่มีเป้าหมายเดียวกันในการต่อต้านการควบคุมจากฝ่ายที่มีอำนาจ การสืบสวนของ Section 9 นำไปสู่การค้นพบว่า บริษัทเหล่านี้และนักการเมืองหลายคนได้ใช้ภาพลักษณ์ของ Laughing Man เพื่อแสวงหาผลประโยชน์จากสาธารณชน
ด้วยการสืบสวนที่เข้มข้นจาก Togusa และ Major Kusanagi ทีมงานของ Section 9 ได้เริ่มเผยแพร่ความจริงเกี่ยวกับการหลอกลวงของบริษัทและการเมือง โดยพยายามเปิดเผยข้อมูลที่รัฐบาลพยายามซ่อนเร้น ทว่ากระบวนการนี้กลับนำไปสู่การล่มสลายของรัฐบาลญี่ปุ่นที่ปัจจุบัน และสมาชิกหลายคนของ Section 9 ถูกจับกุม
